Biodiversitätsforschung wird unter anderem durch die Bereitstellung von Belegen und den zugehörigen Daten nach den FAIR-Prinzipien (findable [auffindbar] – accessible [zugänglich] – interoperable [vereinbar] – reusable [wiederverwendbar]) ermöglicht. Daher liegt ein Schwerpunkt für Forschungsprojekte in der W Kryptogamensammlung auf deren Digitalisierung und dadurch auch auf ihrer Ordnung. Dies ist die Grundlage für unsere und externe taxonomische Forschung basierend auf einer Sammlung, die reich an historischem und originalem Material ist, insbesondere an Belegen aus dem 19. und 20. Jahrhundert und besonders an Typen. Mit Ausnahme ausgewählter Typen wurden bisher nur wenige der geschätzten 1,5 Millionen Exemplare der W-Kryptogamensammlung digitalisiert. Derzeit arbeiten wir daran, die von externen Forschern am häufigsten nachgefragten Sammlungen online bereitzustellen: 1) die Grunow Kieselalgensammlung und 2) die Lindenberg Lebermoos Sammlung. Digitalisierte Daten sind über das Onlineportal JACQ (https://www.jacq.org/#database) verfügbar. Beide Projekte sind in Arbeit und werden aufgrund knapper Ressourcen einige Zeit in Anspruch nehmen.

Digitalisierung der Grunow Sammlung (Diatomeen)

Etwa 3.000 Taxonnamen werden dem Phykologen Albert Grunow (1826 – 1914) zugeschrieben. 1899 schenkte er W seine Sammlung von Kieselalgen und Makroalgen, hauptsächlich Sargassum. Grunows Kieselalgensammlung, sein „Herbar“, bildete die Grundlage der Hauptsammlung von Kieselalgen an W, aber es gibt viele zusätzliche Teile dieser komplexen Sammlung. Sie enthält verschiedene Objekttypen, wie unpräpariertes Material und Herbarbelege in Kapseln, fossile Proben in historischen Pillendöschen, einen Katalog der Proben mit denen er gearbeitet hat, Objektträger (historische und neuere Präparate) für die Mikroskopie, Grunows Zeichnungen, und Bücher, die von Grunow mit den Probenbezeichnungen (Nummern) kommentiert wurden, die er für seine Tafeln verwendet hat. Der Katalog, die Zeichnungen und die kommentierten Bücher sind wichtig für das Auffinden von Typus- und Originalmaterial. Die Teile der Sammlung sind nach verschiedenen Nummerierungssystemen oder in der Hauptsammlung alphabetisch nach Familie, Gattung und Art geordnet (siehe Schuster et al. 2022, 2023 im Reiter „Publikationen“ für weitere Informationen). Grunows Katalog listet 3.278 Nummern von Proben auf, etwa 1.400 seiner Objektträger sind noch erhalten und es gibt zirka 15.000 Zeichnungen.

Aufgrund der Größe und Komplexität der Sammlung nehmen wir die Digitalisierung einzelner Teile Schritt für Schritt in Angriff. Da Grunows Zeichnungen die Grundlage seiner Beschreibungen sind und die von ihm verwendeten Probennummern sowie andere wichtige Details vermerken werden diese zuerst digitalisiert. Der erste Schritt ist die QR-Kodierung, also die Vergabe einer eindeutigen, stabilen Kennung, für die Zeichnungsmappen, gefolgt von einem Foto und Transkription aller Taxonnamen. Letzteres generiert das taxonomische Rückgrat, das für die Eingabe aller anderen Daten in JACQ nötig ist. Weitere Schritte sind die QR-Kodierung und Abbildung jedes Blattes mit Zeichnungen. Die nächsten Schritte sind die Transkription des bereits fotografierten Probenkatalogs. Die Objektträger werden auch fotografiert werden, um zu dokumentieren, welche noch vorhanden sind, um welche Präparationsart es sich handelt (Lufteinbettung mit Schellack, Kanadabalsam, etc.) und welchen Erhaltungszustand sie haben, und um die Etikettdaten, wenn auch spärlich, zu dokumentieren. Die Digitalisierung der Hauptsammlung und des noch verfügbaren Ausgangsmaterials soll folgen.

1. Auffinden der Belege: Dies ist nicht so trivial, wie man annehmen könnte. Belege liegen vielfach unter einem/oder mehreren Synonym(en) und das Herbarium ist nicht nach geografischen Regionen geordnet. Darüber hinaus stammt die Sammlung hauptsächlich aus dem 19. und 20. Jahrhundert und ist geografisch global repräsentiert. Es ist zeitaufwändig eine Vielzahl handgeschriebener Etiketten in sehr unterschiedlicher, veralteter Schrift und mit möglicherweise längst obsoleten Ortsnamen zu entschlüsseln.
2. Sammlungsmanagement und Präparation, Belegsanierung: Da es sich um eine hauptsächlich historische Sammlung handelt, müssen viele Belege laufend saniert werden. Hierbei werden die Aufsammlungen gemäß anerkannter Herbarisierungsstandards zum Schutz auf einer Karte aufgebracht und diese in Umschlägen fixiert, oder eigekapselt.
3. Sammlungsmanagement und Präparation, QR-Codes: Anbringen eines menschen- und maschinenlesbaren QR-Code-Etiketts an jedem Belegelement. Für W-Belege ist seit Januar 2020 ein QR-Code die Zugangsnummer und persistenter Identifikator, der für die Zitierung erforderlich ist. Beachten Sie, dass frühere Akquisitionssnummern in Form einer gestempelten vierstelligen Jahreszahl plus einer laufenden Nummer inzwischen obsolet sind und nicht mehr zitiert werden sollten. Die stabile, eindeutige Kennung (OR-Code) für einen bestimmten Beleg kann in Veröffentlichungen auch als URL für die Verlinkung zu JACQ angegeben werden. Die URL ist die erste Zeile, die auf der JACQ-Ausgabeseite angezeigt wird, beginnt immer mit https://w.jacq.org/W und endet mit der spezifischen QR-Codenummer.
4. Digitalisierung, Eingabe von Namen in die Datenbank (JACQ): Alle relevanten Namen (Familie, Gattung, Art, Varietät, Basionym, Synonyme usw.) müssen dem taxonomischen Rückgrat der JACQ-Datenbank hinzugefügt werden um andere Belegdaten eingeben zu können. Dazu gehören taxonspezifische, persistente Identifikatoren, wie sie in AlgaeBase, DiatomBase, Mycobank, Tropicos usw. verwendet werden. Außerdem ist die Eingabe von Sammlern und Autoren, sowie Kombinationen dieser, notwendig. Weiters ist die Aufnahme nomenklatorischer Informationen (z. B. Typus- und Synonomiestatus, die gegebenenfalls  anhand der Primärliteratur eruiert werden müssen) nötig. Da verhältnismäßig wenige Kryptogamen digitalisiert sind, müssen noch viele Namen fortlaufend hinzugefügt werden.
5. Digitalisierung, Etikettdaten und Revisionszettel: Dies umfasst unter anderem die Eingabe von Sammler(n), deren Sammelnummer, -datum und -ort, Seriennummern von Exsiccata, Angaben auf Revisionszetteln, Identifikationshistorie und Typisierung und andere relevante Informationen am Beleg. Wie erwähnt kann es zeitaufwändig sein, komplexe Information und Abkürzungen in einer Vielzahl historischer Schriften zu entziffern.
6. Digitalisierung, Georeferenzierung: Obwohl es bei historischen Belegen häufig nur wenig Information zum Fundort gibt, ist diese dennoch wichtig für die Identifizierung von Typus- und typoidem Material. Das Entschlüsseln unbekannter Ortsnamen oder jener die nicht mehr in Gebrauch sind, sowie Verweise auf nicht mehr bestehende (Länder-)Grenzen und Zugehörigkeit von Regionen zu bestimmten Ländern kann dies erschweren. Darüber hinaus sind Belege an W nicht geografisch geordnet.
7. Digitalisierung, hochauflösende Bilder: Obwohl oft argumentiert wird, dass hochauflösende Bilder für Kryptogamen nicht relevant sind, da nur wenige der für die Identifizierung erforderlichen Merkmale sichtbar sind, meinen wir, dass Einsicht des Etiketts, Evaluierung des Zustands und der vorhandenen Menge eines Beleges dennoch wertvolle Informationen abgeben. Belege werden dadurch auch dokumentiert, bevor sie entlehnt werden.

BERUFSERFAHRUNG

AKADEMISCHER WERDEGANG

• Sammlungsbezogene Forschung, Sammlungserschließung und- entwicklung.
• Taxonomie der Kieselalgen, mit Schwerpunkt Grunow Sammlung (W) und Vernetzung diverser Institutionen mit Kieselalgensammlungen.
• Evolution der Blütenpflanzen, Erstellung phylogenetischer Stammbäume der Polygonaceae, Coriariaceae, Ericaceae und Myrtaceae (Angophora und Corymbia) basierend auf molekularen und morphologischen Daten.
• Vergleichende Genomik, Hochdurchsatzdaten (HTS).
• Invasive Polygonaceae (Reynoutria [Fallopia], Koenigia [Aconogonon]).
• Polygonaceae als Wirtspflanzen von Pilzen.
• Biogeographie der Südhalbkugel.